Dem Darmmikrobiom wird eine wesentliche Bedeutung bei der Entstehung von chronischen Erkrankungen zugeschrieben. In der NAKO Erstuntersuchung wurden daher bei ca. 100.000 Teilnehmenden Stuhlproben gesammelt. Da eine einmalige Probensammlung keine Berücksichtigung von intraindividuellen Veränderungen des Darmmikrobioms über die Zeit erlaubt, werden an verschiedenen Standorten der NAKO Gesundheitsstudie auch im Rahmen der Zweituntersuchung Stuhlproben gesammelt. Hierzu werden die Teilnehmenden, die schon in der Erstuntersuchung eine Stuhlprobe abgegeben haben, gebeten, erneut eine Stuhlprobe zum Untersuchungstermin mitzubringen.